Daftar universitas di Kupang meliputi daftar jurusan seluruh universitas negeri dan universitas swasta di Kupang dan Nusa Tenggara Timur (NTT) lengkap daftar jurusan kuliah terakreditasi. Termasuk akademi, politeknik dan sekolah tinggi di NTT. Daftar jurusan tersebut adalah program studi atau jurusan yang sudah mendapat akreditasi dari Ban-pt dengan peringkat A (terbaik), B hingga peringkat C.