Peringkat jurusan dan peringkat universitas di Jayapura Papua dapat diketahui dari hasil akreditasi jurusan Ban-pt. Universitas yang lebih banyak memiliki jurusan peringkat A dan B termasuk universitas terbaik dan favorit. Sebaliknya universitas yang jurusannya dominan terakreditasi peringkat C umumnya relatif kurang favorit dan kurang diminati.
Daftar akreditasi universitas di Papua yang